PacBio HiFi定序以其長讀取與高精準的特性,為研究人員提供了更完整、更詳細的微生物基因體資訊,從而對宿主-病原體動態、微生物進化與適應性以及其關鍵特徵,包括藥物抗性、感染能力和毒性等方面帶來更深入的理解。
其應用包含但不限於
- 全長16s rRNA定序:可提供完整無偏差的菌種鑑定結果,分類解析度甚⾄可達“ 株 ( strain )”的層級。
- 宏基因體定序與組裝:每個 read 平均含有 7-9 個完整微⽣物基因,不需組裝就能從容地發掘出基因與操縱⼦ (operon ),讓基因功能註解與代謝路徑重組變得更有效率。
- 微生物全基因體定序:能克服傳統難以定序的⾼重複序列區域、GC-rich 區域,較其它定序平台更輕易組裝出完整的染⾊體與質體。